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この種の短期入院検診は、日本では1954年7月12日に国立東京第一病院（現・国立国際医療センター）で開始されたのが始まりである。その後、聖路加国際病院が相次いで開始した。7月12日は、現在は記念として人間ドックの日となっている。初めは「短期入院精密身体検査」と堅苦しく称されていたが、この検査について報道した読売新聞の記事において「人間ドック」という巧みなネーミングがされたことから、やがてこの呼び方が定着した模様である。語源について作家の山田風太郎は、明治・大正期の軍人大山巌が「人間も船と同じで時々ドックに入って検査しないといかん」と言っていたことを「人間臨終図巻」の中で紹介して「人間ドックという言葉の由来は大山かもしれない」と書いている。ただし大山の言葉が確実な語源であるという裏付けはない。
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藤保クリニック
東京都新宿区北新宿3丁目26−22
医院・診療所，胃腸外科，胃腸内科，外科，呼吸器外科，呼吸器内科，循環器外科，循環器ドック，循環器内科，消化器外科，消化器ドック，消化器内科，小児科，神経内科，心臓ドック，整形外科，精神科，大腸ドック，内科，人間ドック，脳神経外科，脳ドック，肺ドック，皮膚科，リハビリテーション科
（財）東京都予防医学協会
東京都新宿区市谷砂土原町1丁目2
循環器ドック，人間ドック，婦人科ドック
（株）メディカルヘルス
東京都新宿区新宿1丁目8−11
人間ドック
ヒロオカクリニック
東京都新宿区新宿2丁目3−11
医院・診療所，アレルギー科，外科，小児科，整形外科，内科，人間ドック，泌尿器科，皮膚科，リハビリテーション科
新宿東口クリニック
東京都新宿区新宿3丁目17−5
アレルギー科，性感染症内科，内科，人間ドック，皮膚科，放射線科
藤村内科外科クリニック
東京都新宿区新宿5丁目10−12
医院・診療所，胃腸内科，循環器内科，消化器内科，整形外科，内科，人間ドック，リハビリテーション科
芙蓉診療所成人病医学センター
東京都新宿区新宿5丁目14−5
fuyoclin@topaz.ocn.ne.jp
岡崎医院
東京都新宿区早稲田鶴巻町519
医院・診療所，外科，整形外科，内科，人間ドック
東京厚生年金病院
東京都新宿区津久戸町5−1
総合病院，眼科，形成外科，外科，呼吸器内科，産婦人科，歯科，歯科口腔外科，耳鼻咽喉科，循環器内科，消化器内科，小児科，神経内科，整形外科，内科，人間ドック，脳神経外科，脳ドック，泌尿器科，皮膚科，放射線科，麻酔科，リハビリテーション科
明宝ビル診療所
東京都新宿区西新宿1丁目21−1
内科，人間ドック，皮膚科
（財）明治安田厚生事業団新宿健診センター
東京都新宿区西新宿1丁目8−3
人間ドック
新宿三井ビルクリニック
東京都新宿区西新宿2丁目1−1
医院・診療所，胃腸内科，循環器ドック，循環器内科，消化器ドック，消化器内科，人間ドック
水町クリニック
東京都新宿区西新宿2丁目7−1
医院・診療所，整形外科，内科，人間ドック，脳神経外科，泌尿器科
三恵クリニック
東京都新宿区西新宿4丁目32−4
人間ドック
金内メディカルクリニック
東京都新宿区西新宿7丁目5−25
医院・診療所，外科，消化器外科，消化器内科，神経内科，内科，人間ドック
西早稲田クリニック
東京都新宿区西早稲田2丁目15−10
内科，人間ドック
腎研クリニック
東京都新宿区高田馬場1丁目33−13
循環器内科，内科，人間ドック
慈友クリニック
東京都新宿区高田馬場4丁目3−11
病院・療養所，胃腸外科，胃腸内科，循環器外科，循環器内科，消化器外科，消化器内科，心療内科，内科，人間ドック
